Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp6Q3U6U5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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