Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q3U595 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q3U595 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3U595 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3U595 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3U595 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3U595 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3U595 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U595 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3U595 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U595 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U595 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3U595 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3U595 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms