Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kdm4dQ3U2K5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Kdm4dQ3U2K5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Kdm4dQ3U2K5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kdm4dQ3U2K5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms