Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam193bQ3U2K0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam193bQ3U2K0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam193bQ3U2K0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam193bQ3U2K0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam193bQ3U2K0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam193bQ3U2K0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam193bQ3U2K0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms