Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf149Q3U2C5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Rnf149Q3U2C5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Rnf149Q3U2C5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf149Q3U2C5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rnf149Q3U2C5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rnf149Q3U2C5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rnf149Q3U2C5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf149Q3U2C5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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