Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rasip1Q3U0S6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rasip1Q3U0S6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasip1Q3U0S6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasip1Q3U0S6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rasip1Q3U0S6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms