Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc9Q3U0M1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc9Q3U0M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms