Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hbq1bQ3U0A6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Hbq1bQ3U0A6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hbq1bQ3U0A6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms