Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdnep1Q3TP92 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdnep1Q3TP92 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms