Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms