Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp39Q3TIX9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp39Q3TIX9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp39Q3TIX9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms