Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY0

Igfn1, Immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfn1Q3KNY0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igfn1Q3KNY0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igfn1Q3KNY0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igfn1Q3KNY0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms