Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
H2-M3Q31093 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M3Q31093 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms