Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col24a1Q30D77 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col24a1Q30D77 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col24a1Q30D77 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms