Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trpm1Q2TV84 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms