Protein–RNA interactions for Protein: Q2PZL6

Fat4, Protocadherin Fat 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fat4Q2PZL6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Fat4Q2PZL6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Fat4Q2PZL6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Fat4Q2PZL6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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