Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smrp1Q2MH31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smrp1Q2MH31 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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