Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rhox4cQ2MDG1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rhox4cQ2MDG1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms