Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp1aQ2LKU9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms