Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spatc1Q148B6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Spatc1Q148B6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
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Spatc1Q148B6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Spatc1Q148B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Spatc1Q148B6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spatc1Q148B6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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