Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col19a1Q0VF58 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col19a1Q0VF58 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col19a1Q0VF58 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms