Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb8Q0VBD0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Itgb8Q0VBD0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms