Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5cQ0V8T7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cntnap5cQ0V8T7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms