Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Zc3h18Q0P678 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h18Q0P678 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h18Q0P678 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 429.6 ms