Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1bQ0MW30 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1bQ0MW30 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1bQ0MW30 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms