Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf541Q0GGX2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf541Q0GGX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf541Q0GGX2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms