Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700061G19RikQ08EE8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700061G19RikQ08EE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms