Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tgm3Q08189 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tgm3Q08189 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms