Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CbfbQ08024 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CbfbQ08024 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms