Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmbpQ07456 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmbpQ07456 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms