Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnal1Q05A62 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnal1Q05A62 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms