Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PtprgQ05909 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprgQ05909 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprgQ05909 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms