Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs3Q05895 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs3Q05895 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms