Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SryQ05738 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SryQ05738 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SryQ05738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SryQ05738 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SryQ05738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SryQ05738 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SryQ05738 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SryQ05738 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SryQ05738 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SryQ05738 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms