Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Smarcad1Q04692 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smarcad1Q04692 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms