Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CkbQ04447 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CkbQ04447 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CkbQ04447 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CkbQ04447 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CkbQ04447 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CkbQ04447 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms