Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GscQ02591 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GscQ02591 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GscQ02591 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GscQ02591 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GscQ02591 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GscQ02591 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GscQ02591 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GscQ02591 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GscQ02591 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GscQ02591 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GscQ02591 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GscQ02591 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GscQ02591 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GscQ02591 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms