Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PrkcqQ02111 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms