Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VcpQ01853 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VcpQ01853 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VcpQ01853 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms