Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EgfrQ01279 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EgfrQ01279 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EgfrQ01279 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms