Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HmgcrQ01237 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms