Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2cQ01098 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms