Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csf2raQ00941 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf2raQ00941 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf2raQ00941 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csf2raQ00941 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csf2raQ00941 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csf2raQ00941 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms