Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabpb1Q00420 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabpb1Q00420 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms