Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax8Q00288 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax8Q00288 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms