Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Npas1P97459 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Npas1P97459 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Npas1P97459 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms