Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1b3P97370 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1b3P97370 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp1b3P97370 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms