Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Meis3P97368 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis3P97368 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Meis3P97368 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis3P97368 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Meis3P97368 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Meis3P97368 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Meis3P97368 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Meis3P97368 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Meis3P97368 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Meis3P97368 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Meis3P97368 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Meis3P97368 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms