Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rps3aP97351 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rps3aP97351 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms