Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkp1P97350 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkp1P97350 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms